Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms