Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCK2Q16822 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms