Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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