Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ALX1Q15699 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
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