Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SF1Q15637 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SF1Q15637 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SF1Q15637 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SF1Q15637 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SF1Q15637 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SF1Q15637 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SF1Q15637 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SF1Q15637 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SF1Q15637 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SF1Q15637 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SF1Q15637 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SF1Q15637 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SF1Q15637 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SF1Q15637 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SF1Q15637 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SF1Q15637 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SF1Q15637 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SF1Q15637 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SF1Q15637 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SF1Q15637 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SF1Q15637 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SF1Q15637 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SF1Q15637 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SF1Q15637 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SF1Q15637 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SF1Q15637 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SF1Q15637 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SF1Q15637 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SF1Q15637 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SF1Q15637 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SF1Q15637 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SF1Q15637 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SF1Q15637 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SF1Q15637 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SF1Q15637 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SF1Q15637 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SF1Q15637 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SF1Q15637 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SF1Q15637 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SF1Q15637 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SF1Q15637 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SF1Q15637 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SF1Q15637 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SF1Q15637 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SF1Q15637 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SF1Q15637 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SF1Q15637 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SF1Q15637 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SF1Q15637 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SF1Q15637 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SF1Q15637 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SF1Q15637 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SF1Q15637 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SF1Q15637 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SF1Q15637 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SF1Q15637 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SF1Q15637 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SF1Q15637 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SF1Q15637 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SF1Q15637 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SF1Q15637 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SF1Q15637 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SF1Q15637 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SF1Q15637 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SF1Q15637 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SF1Q15637 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SF1Q15637 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SF1Q15637 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SF1Q15637 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SF1Q15637 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SF1Q15637 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SF1Q15637 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SF1Q15637 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SF1Q15637 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SF1Q15637 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SF1Q15637 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SF1Q15637 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SF1Q15637 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SF1Q15637 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SF1Q15637 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SF1Q15637 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SF1Q15637 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SF1Q15637 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SF1Q15637 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SF1Q15637 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SF1Q15637 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SF1Q15637 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SF1Q15637 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SF1Q15637 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SF1Q15637 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SF1Q15637 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SF1Q15637 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SF1Q15637 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SF1Q15637 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SF1Q15637 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SF1Q15637 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SF1Q15637 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SF1Q15637 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SF1Q15637 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
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