Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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TAF1AQ15573 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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