Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms