Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC31.04■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC31.04■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC31.02■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
GAPVD1Q14C86 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
GAPVD1Q14C86 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
GAPVD1Q14C86 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
GAPVD1Q14C86 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
GAPVD1Q14C86 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GAPVD1Q14C86 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
GAPVD1Q14C86 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
GAPVD1Q14C86 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
GAPVD1Q14C86 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC31■■■□□ 2.55
GAPVD1Q14C86 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GAPVD1Q14C86 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC31■■■□□ 2.55
GAPVD1Q14C86 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC31■■■□□ 2.55
GAPVD1Q14C86 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GAPVD1Q14C86 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GAPVD1Q14C86 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
GAPVD1Q14C86 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
GAPVD1Q14C86 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
GAPVD1Q14C86 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC30.99■■■□□ 2.55
GAPVD1Q14C86 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
GAPVD1Q14C86 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
GAPVD1Q14C86 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
GAPVD1Q14C86 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
GAPVD1Q14C86 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
GAPVD1Q14C86 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
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