Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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GPNMBQ14956 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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GPNMBQ14956 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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GPNMBQ14956 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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GPNMBQ14956 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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GPNMBQ14956 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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GPNMBQ14956 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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