Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms