Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
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