Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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COL4A6Q14031 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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COL4A6Q14031 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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COL4A6Q14031 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms