Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAPSQ13938 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAPSQ13938 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAPSQ13938 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAPSQ13938 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAPSQ13938 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CAPSQ13938 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAPSQ13938 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAPSQ13938 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CAPSQ13938 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAPSQ13938 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAPSQ13938 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAPSQ13938 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CAPSQ13938 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAPSQ13938 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAPSQ13938 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAPSQ13938 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CAPSQ13938 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CAPSQ13938 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAPSQ13938 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAPSQ13938 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAPSQ13938 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAPSQ13938 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAPSQ13938 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAPSQ13938 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAPSQ13938 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CAPSQ13938 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms