Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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