Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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PEX6Q13608 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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PEX6Q13608 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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PEX6Q13608 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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PEX6Q13608 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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PEX6Q13608 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
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PEX6Q13608 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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PEX6Q13608 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PEX6Q13608 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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