Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Length 498 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IRF5Q13568 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRF5Q13568 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IRF5Q13568 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.31■■□□□ 1
IRF5Q13568 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IRF5Q13568 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IRF5Q13568 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IRF5Q13568 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.31■■□□□ 1
IRF5Q13568 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
IRF5Q13568 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.31■■□□□ 1
IRF5Q13568 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IRF5Q13568 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRF5Q13568 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IRF5Q13568 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IRF5Q13568 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IRF5Q13568 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRF5Q13568 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRF5Q13568 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRF5Q13568 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IRF5Q13568 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IRF5Q13568 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRF5Q13568 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IRF5Q13568 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRF5Q13568 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRF5Q13568 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IRF5Q13568 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRF5Q13568 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IRF5Q13568 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IRF5Q13568 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IRF5Q13568 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRF5Q13568 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IRF5Q13568 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRF5Q13568 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRF5Q13568 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRF5Q13568 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IRF5Q13568 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
IRF5Q13568 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IRF5Q13568 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IRF5Q13568 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IRF5Q13568 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRF5Q13568 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
IRF5Q13568 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IRF5Q13568 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
IRF5Q13568 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IRF5Q13568 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IRF5Q13568 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IRF5Q13568 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IRF5Q13568 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IRF5Q13568 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRF5Q13568 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IRF5Q13568 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRF5Q13568 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IRF5Q13568 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IRF5Q13568 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRF5Q13568 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRF5Q13568 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IRF5Q13568 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRF5Q13568 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRF5Q13568 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRF5Q13568 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IRF5Q13568 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IRF5Q13568 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IRF5Q13568 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRF5Q13568 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IRF5Q13568 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IRF5Q13568 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
IRF5Q13568 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IRF5Q13568 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IRF5Q13568 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRF5Q13568 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRF5Q13568 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IRF5Q13568 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRF5Q13568 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IRF5Q13568 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRF5Q13568 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IRF5Q13568 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRF5Q13568 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRF5Q13568 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRF5Q13568 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRF5Q13568 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IRF5Q13568 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IRF5Q13568 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
IRF5Q13568 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IRF5Q13568 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
IRF5Q13568 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IRF5Q13568 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IRF5Q13568 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IRF5Q13568 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRF5Q13568 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IRF5Q13568 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IRF5Q13568 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRF5Q13568 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRF5Q13568 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRF5Q13568 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRF5Q13568 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IRF5Q13568 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRF5Q13568 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRF5Q13568 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRF5Q13568 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRF5Q13568 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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