Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NEUROD1Q13562 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms