Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
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PRPF4BQ13523 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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PRPF4BQ13523 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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PRPF4BQ13523 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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