Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATMQ13315 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATMQ13315 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ATMQ13315 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATMQ13315 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATMQ13315 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATMQ13315 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATMQ13315 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATMQ13315 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATMQ13315 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATMQ13315 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATMQ13315 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATMQ13315 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATMQ13315 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATMQ13315 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATMQ13315 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATMQ13315 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATMQ13315 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATMQ13315 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATMQ13315 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATMQ13315 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATMQ13315 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATMQ13315 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATMQ13315 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ATMQ13315 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ATMQ13315 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATMQ13315 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATMQ13315 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATMQ13315 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATMQ13315 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATMQ13315 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATMQ13315 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATMQ13315 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATMQ13315 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATMQ13315 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATMQ13315 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATMQ13315 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATMQ13315 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATMQ13315 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATMQ13315 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATMQ13315 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATMQ13315 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATMQ13315 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATMQ13315 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATMQ13315 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATMQ13315 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATMQ13315 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATMQ13315 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATMQ13315 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ATMQ13315 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATMQ13315 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATMQ13315 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATMQ13315 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATMQ13315 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATMQ13315 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATMQ13315 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATMQ13315 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATMQ13315 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATMQ13315 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ATMQ13315 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATMQ13315 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATMQ13315 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATMQ13315 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ATMQ13315 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATMQ13315 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATMQ13315 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATMQ13315 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATMQ13315 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATMQ13315 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATMQ13315 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATMQ13315 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATMQ13315 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATMQ13315 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATMQ13315 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATMQ13315 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATMQ13315 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATMQ13315 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATMQ13315 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATMQ13315 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATMQ13315 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATMQ13315 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATMQ13315 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATMQ13315 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATMQ13315 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATMQ13315 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ATMQ13315 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATMQ13315 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATMQ13315 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATMQ13315 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATMQ13315 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATMQ13315 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATMQ13315 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATMQ13315 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATMQ13315 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATMQ13315 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATMQ13315 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATMQ13315 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATMQ13315 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATMQ13315 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATMQ13315 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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