Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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