Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
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