Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
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