Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms