Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXI1Q12951 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms