Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
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FOXC1Q12948 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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FOXC1Q12948 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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FOXC1Q12948 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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FOXC1Q12948 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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