Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms