Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNH2Q12809 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms