Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FMODQ06828 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FMODQ06828 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FMODQ06828 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FMODQ06828 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FMODQ06828 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FMODQ06828 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FMODQ06828 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FMODQ06828 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FMODQ06828 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FMODQ06828 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FMODQ06828 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FMODQ06828 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FMODQ06828 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FMODQ06828 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FMODQ06828 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FMODQ06828 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FMODQ06828 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FMODQ06828 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FMODQ06828 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FMODQ06828 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FMODQ06828 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FMODQ06828 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FMODQ06828 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FMODQ06828 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FMODQ06828 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FMODQ06828 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FMODQ06828 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FMODQ06828 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FMODQ06828 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FMODQ06828 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FMODQ06828 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FMODQ06828 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FMODQ06828 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FMODQ06828 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FMODQ06828 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FMODQ06828 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FMODQ06828 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FMODQ06828 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FMODQ06828 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FMODQ06828 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FMODQ06828 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FMODQ06828 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FMODQ06828 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FMODQ06828 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FMODQ06828 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FMODQ06828 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FMODQ06828 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FMODQ06828 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FMODQ06828 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FMODQ06828 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FMODQ06828 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FMODQ06828 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FMODQ06828 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FMODQ06828 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FMODQ06828 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FMODQ06828 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FMODQ06828 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FMODQ06828 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FMODQ06828 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FMODQ06828 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FMODQ06828 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FMODQ06828 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FMODQ06828 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FMODQ06828 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FMODQ06828 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FMODQ06828 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FMODQ06828 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FMODQ06828 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FMODQ06828 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FMODQ06828 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FMODQ06828 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FMODQ06828 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FMODQ06828 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FMODQ06828 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FMODQ06828 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FMODQ06828 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FMODQ06828 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FMODQ06828 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FMODQ06828 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FMODQ06828 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FMODQ06828 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FMODQ06828 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FMODQ06828 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FMODQ06828 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FMODQ06828 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FMODQ06828 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FMODQ06828 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FMODQ06828 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FMODQ06828 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FMODQ06828 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FMODQ06828 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FMODQ06828 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FMODQ06828 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FMODQ06828 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FMODQ06828 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FMODQ06828 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FMODQ06828 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FMODQ06828 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FMODQ06828 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms