Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSME1Q06323 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms