Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms