Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
EMX2Q04743 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms