Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCNT1Q02742 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms