Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms