Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms