Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKP1P63208 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKP1P63208 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKP1P63208 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKP1P63208 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKP1P63208 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKP1P63208 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKP1P63208 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SKP1P63208 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKP1P63208 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKP1P63208 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKP1P63208 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKP1P63208 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SKP1P63208 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKP1P63208 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKP1P63208 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKP1P63208 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKP1P63208 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKP1P63208 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKP1P63208 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKP1P63208 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKP1P63208 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKP1P63208 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKP1P63208 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKP1P63208 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKP1P63208 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SKP1P63208 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKP1P63208 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKP1P63208 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKP1P63208 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKP1P63208 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKP1P63208 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKP1P63208 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKP1P63208 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKP1P63208 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKP1P63208 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKP1P63208 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SKP1P63208 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKP1P63208 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKP1P63208 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKP1P63208 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKP1P63208 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SKP1P63208 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKP1P63208 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKP1P63208 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKP1P63208 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SKP1P63208 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKP1P63208 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SKP1P63208 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKP1P63208 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKP1P63208 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKP1P63208 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKP1P63208 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKP1P63208 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKP1P63208 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKP1P63208 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKP1P63208 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SKP1P63208 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKP1P63208 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKP1P63208 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKP1P63208 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKP1P63208 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKP1P63208 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKP1P63208 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKP1P63208 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKP1P63208 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKP1P63208 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKP1P63208 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SKP1P63208 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKP1P63208 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKP1P63208 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKP1P63208 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKP1P63208 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKP1P63208 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKP1P63208 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKP1P63208 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKP1P63208 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKP1P63208 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKP1P63208 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKP1P63208 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKP1P63208 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKP1P63208 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKP1P63208 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SKP1P63208 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKP1P63208 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKP1P63208 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKP1P63208 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKP1P63208 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKP1P63208 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKP1P63208 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKP1P63208 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKP1P63208 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKP1P63208 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SKP1P63208 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SKP1P63208 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKP1P63208 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKP1P63208 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKP1P63208 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKP1P63208 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKP1P63208 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms