Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNRPD2P62316 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms