Protein–RNA interactions for Protein: P60842

EIF4A1, Eukaryotic initiation factor 4A-I, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A1P60842 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF4A1P60842 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF4A1P60842 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF4A1P60842 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF4A1P60842 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF4A1P60842 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF4A1P60842 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF4A1P60842 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF4A1P60842 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF4A1P60842 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF4A1P60842 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF4A1P60842 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF4A1P60842 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF4A1P60842 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF4A1P60842 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF4A1P60842 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF4A1P60842 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF4A1P60842 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF4A1P60842 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF4A1P60842 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF4A1P60842 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF4A1P60842 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF4A1P60842 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF4A1P60842 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF4A1P60842 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF4A1P60842 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF4A1P60842 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF4A1P60842 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF4A1P60842 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF4A1P60842 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF4A1P60842 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF4A1P60842 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF4A1P60842 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF4A1P60842 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF4A1P60842 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF4A1P60842 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF4A1P60842 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF4A1P60842 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF4A1P60842 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF4A1P60842 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EIF4A1P60842 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF4A1P60842 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.2 ms