Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP107P57740 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP107P57740 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP107P57740 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP107P57740 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP107P57740 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP107P57740 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP107P57740 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP107P57740 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP107P57740 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP107P57740 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP107P57740 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP107P57740 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP107P57740 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP107P57740 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP107P57740 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP107P57740 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP107P57740 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP107P57740 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP107P57740 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP107P57740 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP107P57740 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP107P57740 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP107P57740 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP107P57740 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP107P57740 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP107P57740 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP107P57740 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP107P57740 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP107P57740 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP107P57740 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP107P57740 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP107P57740 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP107P57740 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP107P57740 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP107P57740 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP107P57740 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP107P57740 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP107P57740 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP107P57740 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP107P57740 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP107P57740 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP107P57740 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP107P57740 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP107P57740 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP107P57740 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP107P57740 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP107P57740 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP107P57740 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP107P57740 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP107P57740 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP107P57740 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP107P57740 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP107P57740 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP107P57740 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP107P57740 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP107P57740 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP107P57740 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP107P57740 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP107P57740 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP107P57740 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP107P57740 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP107P57740 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP107P57740 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP107P57740 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP107P57740 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP107P57740 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP107P57740 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP107P57740 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP107P57740 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP107P57740 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP107P57740 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP107P57740 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP107P57740 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP107P57740 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP107P57740 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP107P57740 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP107P57740 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP107P57740 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP107P57740 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP107P57740 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP107P57740 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP107P57740 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP107P57740 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP107P57740 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP107P57740 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP107P57740 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP107P57740 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP107P57740 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP107P57740 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP107P57740 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP107P57740 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP107P57740 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP107P57740 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP107P57740 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP107P57740 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP107P57740 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP107P57740 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP107P57740 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP107P57740 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms