Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP98P52948 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP98P52948 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP98P52948 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP98P52948 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP98P52948 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP98P52948 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP98P52948 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP98P52948 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP98P52948 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP98P52948 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP98P52948 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP98P52948 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP98P52948 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP98P52948 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP98P52948 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP98P52948 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP98P52948 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP98P52948 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP98P52948 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP98P52948 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP98P52948 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP98P52948 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP98P52948 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP98P52948 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP98P52948 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP98P52948 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP98P52948 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP98P52948 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP98P52948 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP98P52948 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP98P52948 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP98P52948 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP98P52948 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP98P52948 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP98P52948 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP98P52948 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP98P52948 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP98P52948 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP98P52948 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP98P52948 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP98P52948 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP98P52948 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP98P52948 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP98P52948 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP98P52948 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP98P52948 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP98P52948 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP98P52948 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP98P52948 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP98P52948 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP98P52948 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP98P52948 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP98P52948 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP98P52948 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP98P52948 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP98P52948 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP98P52948 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP98P52948 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP98P52948 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP98P52948 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP98P52948 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP98P52948 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP98P52948 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP98P52948 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP98P52948 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP98P52948 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP98P52948 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP98P52948 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP98P52948 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP98P52948 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP98P52948 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP98P52948 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP98P52948 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP98P52948 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP98P52948 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP98P52948 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP98P52948 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP98P52948 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP98P52948 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP98P52948 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP98P52948 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP98P52948 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP98P52948 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP98P52948 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP98P52948 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP98P52948 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP98P52948 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP98P52948 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP98P52948 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP98P52948 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP98P52948 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP98P52948 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NUP98P52948 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NUP98P52948 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NUP98P52948 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP98P52948 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP98P52948 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP98P52948 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP98P52948 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms