Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DAP3P51398 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DAP3P51398 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DAP3P51398 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DAP3P51398 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DAP3P51398 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DAP3P51398 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DAP3P51398 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DAP3P51398 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DAP3P51398 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DAP3P51398 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DAP3P51398 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DAP3P51398 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DAP3P51398 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DAP3P51398 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DAP3P51398 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DAP3P51398 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DAP3P51398 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DAP3P51398 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DAP3P51398 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DAP3P51398 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DAP3P51398 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DAP3P51398 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DAP3P51398 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DAP3P51398 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DAP3P51398 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DAP3P51398 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DAP3P51398 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DAP3P51398 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DAP3P51398 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DAP3P51398 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DAP3P51398 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DAP3P51398 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DAP3P51398 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DAP3P51398 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DAP3P51398 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DAP3P51398 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DAP3P51398 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DAP3P51398 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DAP3P51398 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DAP3P51398 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DAP3P51398 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DAP3P51398 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DAP3P51398 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DAP3P51398 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DAP3P51398 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DAP3P51398 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
DAP3P51398 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DAP3P51398 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DAP3P51398 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DAP3P51398 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DAP3P51398 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DAP3P51398 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DAP3P51398 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DAP3P51398 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DAP3P51398 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DAP3P51398 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
DAP3P51398 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
DAP3P51398 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DAP3P51398 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DAP3P51398 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DAP3P51398 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DAP3P51398 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DAP3P51398 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DAP3P51398 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DAP3P51398 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DAP3P51398 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DAP3P51398 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DAP3P51398 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DAP3P51398 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DAP3P51398 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DAP3P51398 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DAP3P51398 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DAP3P51398 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DAP3P51398 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DAP3P51398 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DAP3P51398 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DAP3P51398 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DAP3P51398 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DAP3P51398 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DAP3P51398 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DAP3P51398 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DAP3P51398 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DAP3P51398 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DAP3P51398 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DAP3P51398 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DAP3P51398 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DAP3P51398 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DAP3P51398 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DAP3P51398 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DAP3P51398 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DAP3P51398 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DAP3P51398 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DAP3P51398 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DAP3P51398 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DAP3P51398 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DAP3P51398 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DAP3P51398 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DAP3P51398 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DAP3P51398 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms