Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLCSP50747 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLCSP50747 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLCSP50747 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLCSP50747 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLCSP50747 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLCSP50747 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLCSP50747 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HLCSP50747 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLCSP50747 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLCSP50747 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLCSP50747 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLCSP50747 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLCSP50747 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLCSP50747 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLCSP50747 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLCSP50747 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLCSP50747 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLCSP50747 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLCSP50747 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLCSP50747 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLCSP50747 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLCSP50747 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLCSP50747 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLCSP50747 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLCSP50747 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HLCSP50747 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HLCSP50747 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLCSP50747 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLCSP50747 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLCSP50747 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLCSP50747 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLCSP50747 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLCSP50747 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLCSP50747 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLCSP50747 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HLCSP50747 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HLCSP50747 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HLCSP50747 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HLCSP50747 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HLCSP50747 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
HLCSP50747 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HLCSP50747 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HLCSP50747 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HLCSP50747 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HLCSP50747 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HLCSP50747 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HLCSP50747 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HLCSP50747 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLCSP50747 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLCSP50747 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLCSP50747 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLCSP50747 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLCSP50747 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLCSP50747 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HLCSP50747 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HLCSP50747 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLCSP50747 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLCSP50747 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLCSP50747 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLCSP50747 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLCSP50747 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLCSP50747 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLCSP50747 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLCSP50747 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLCSP50747 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLCSP50747 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLCSP50747 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLCSP50747 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLCSP50747 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLCSP50747 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLCSP50747 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLCSP50747 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLCSP50747 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLCSP50747 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLCSP50747 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLCSP50747 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLCSP50747 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLCSP50747 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLCSP50747 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLCSP50747 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLCSP50747 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLCSP50747 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLCSP50747 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLCSP50747 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLCSP50747 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HLCSP50747 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLCSP50747 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLCSP50747 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HLCSP50747 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLCSP50747 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLCSP50747 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLCSP50747 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLCSP50747 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLCSP50747 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLCSP50747 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLCSP50747 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLCSP50747 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLCSP50747 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLCSP50747 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms