Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATRXP46100 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATRXP46100 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATRXP46100 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATRXP46100 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATRXP46100 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATRXP46100 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATRXP46100 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATRXP46100 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATRXP46100 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRXP46100 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRXP46100 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRXP46100 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRXP46100 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRXP46100 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRXP46100 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRXP46100 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRXP46100 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRXP46100 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRXP46100 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRXP46100 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRXP46100 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRXP46100 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRXP46100 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRXP46100 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRXP46100 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRXP46100 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRXP46100 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRXP46100 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRXP46100 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRXP46100 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRXP46100 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRXP46100 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRXP46100 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRXP46100 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRXP46100 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRXP46100 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRXP46100 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRXP46100 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRXP46100 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRXP46100 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRXP46100 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRXP46100 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRXP46100 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRXP46100 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRXP46100 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATRXP46100 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATRXP46100 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATRXP46100 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATRXP46100 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATRXP46100 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATRXP46100 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATRXP46100 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ATRXP46100 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATRXP46100 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATRXP46100 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATRXP46100 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATRXP46100 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATRXP46100 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATRXP46100 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATRXP46100 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATRXP46100 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATRXP46100 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATRXP46100 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATRXP46100 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATRXP46100 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATRXP46100 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRXP46100 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRXP46100 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRXP46100 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRXP46100 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRXP46100 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRXP46100 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRXP46100 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRXP46100 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRXP46100 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRXP46100 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRXP46100 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRXP46100 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRXP46100 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRXP46100 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRXP46100 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRXP46100 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRXP46100 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRXP46100 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRXP46100 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRXP46100 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRXP46100 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRXP46100 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRXP46100 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRXP46100 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRXP46100 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRXP46100 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRXP46100 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRXP46100 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRXP46100 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRXP46100 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRXP46100 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRXP46100 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRXP46100 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms