Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
ITGAEP38570 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms