Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LTBRP36941 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTBRP36941 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTBRP36941 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTBRP36941 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTBRP36941 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTBRP36941 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTBRP36941 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LTBRP36941 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTBRP36941 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTBRP36941 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTBRP36941 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTBRP36941 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTBRP36941 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTBRP36941 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTBRP36941 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTBRP36941 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTBRP36941 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTBRP36941 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTBRP36941 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTBRP36941 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTBRP36941 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTBRP36941 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTBRP36941 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTBRP36941 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LTBRP36941 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTBRP36941 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTBRP36941 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTBRP36941 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTBRP36941 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTBRP36941 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTBRP36941 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTBRP36941 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTBRP36941 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTBRP36941 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTBRP36941 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTBRP36941 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTBRP36941 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTBRP36941 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTBRP36941 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTBRP36941 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTBRP36941 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTBRP36941 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LTBRP36941 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTBRP36941 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTBRP36941 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTBRP36941 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTBRP36941 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTBRP36941 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTBRP36941 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTBRP36941 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTBRP36941 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTBRP36941 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LTBRP36941 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTBRP36941 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTBRP36941 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTBRP36941 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTBRP36941 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTBRP36941 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTBRP36941 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTBRP36941 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTBRP36941 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTBRP36941 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTBRP36941 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTBRP36941 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTBRP36941 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTBRP36941 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTBRP36941 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTBRP36941 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTBRP36941 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTBRP36941 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTBRP36941 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTBRP36941 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
LTBRP36941 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTBRP36941 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTBRP36941 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTBRP36941 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
LTBRP36941 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTBRP36941 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTBRP36941 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTBRP36941 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTBRP36941 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTBRP36941 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTBRP36941 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTBRP36941 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
LTBRP36941 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTBRP36941 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTBRP36941 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTBRP36941 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTBRP36941 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
LTBRP36941 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTBRP36941 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTBRP36941 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTBRP36941 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTBRP36941 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTBRP36941 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTBRP36941 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTBRP36941 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTBRP36941 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTBRP36941 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms