Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP6V1E1P36543 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms