Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms