Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRMP28827 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
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