Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXP28300 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXP28300 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXP28300 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXP28300 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXP28300 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXP28300 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXP28300 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXP28300 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXP28300 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXP28300 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXP28300 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXP28300 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXP28300 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXP28300 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXP28300 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXP28300 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXP28300 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXP28300 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXP28300 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXP28300 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXP28300 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXP28300 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXP28300 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXP28300 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXP28300 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXP28300 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXP28300 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LOXP28300 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LOXP28300 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXP28300 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXP28300 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXP28300 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXP28300 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXP28300 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXP28300 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXP28300 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXP28300 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXP28300 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXP28300 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXP28300 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXP28300 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXP28300 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXP28300 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXP28300 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXP28300 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXP28300 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXP28300 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXP28300 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXP28300 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXP28300 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXP28300 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXP28300 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXP28300 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXP28300 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXP28300 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXP28300 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXP28300 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXP28300 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXP28300 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXP28300 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXP28300 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXP28300 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXP28300 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXP28300 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXP28300 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXP28300 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXP28300 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXP28300 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXP28300 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXP28300 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXP28300 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXP28300 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXP28300 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXP28300 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXP28300 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXP28300 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXP28300 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXP28300 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXP28300 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXP28300 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXP28300 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXP28300 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXP28300 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXP28300 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXP28300 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXP28300 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXP28300 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXP28300 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXP28300 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXP28300 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXP28300 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXP28300 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXP28300 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXP28300 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXP28300 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXP28300 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXP28300 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXP28300 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXP28300 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms