Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HMGB2P26583 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HMGB2P26583 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HMGB2P26583 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms