Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ME2P23368 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ME2P23368 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ME2P23368 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ME2P23368 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ME2P23368 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ME2P23368 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ME2P23368 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ME2P23368 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ME2P23368 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ME2P23368 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ME2P23368 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ME2P23368 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ME2P23368 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ME2P23368 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ME2P23368 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ME2P23368 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ME2P23368 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ME2P23368 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ME2P23368 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ME2P23368 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ME2P23368 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ME2P23368 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ME2P23368 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ME2P23368 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ME2P23368 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ME2P23368 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ME2P23368 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ME2P23368 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ME2P23368 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ME2P23368 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ME2P23368 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ME2P23368 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ME2P23368 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ME2P23368 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ME2P23368 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ME2P23368 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ME2P23368 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ME2P23368 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ME2P23368 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ME2P23368 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ME2P23368 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ME2P23368 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ME2P23368 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ME2P23368 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME2P23368 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME2P23368 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME2P23368 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME2P23368 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME2P23368 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME2P23368 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME2P23368 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME2P23368 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME2P23368 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME2P23368 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME2P23368 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME2P23368 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME2P23368 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME2P23368 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ME2P23368 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME2P23368 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME2P23368 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME2P23368 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME2P23368 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME2P23368 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME2P23368 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME2P23368 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME2P23368 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ME2P23368 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ME2P23368 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ME2P23368 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ME2P23368 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ME2P23368 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ME2P23368 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ME2P23368 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ME2P23368 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ME2P23368 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ME2P23368 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ME2P23368 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ME2P23368 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ME2P23368 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ME2P23368 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ME2P23368 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ME2P23368 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ME2P23368 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ME2P23368 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ME2P23368 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ME2P23368 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ME2P23368 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ME2P23368 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ME2P23368 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME2P23368 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME2P23368 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME2P23368 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME2P23368 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME2P23368 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME2P23368 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME2P23368 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ME2P23368 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME2P23368 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms